Do súčasnosti bola popísaná celá rada negatívnych účinkov pesticídov na ľudské zdravie. Niektoré pesticídne látky sú dávané do priamej súvislosti so vznikom rôznych typov rakoviny, negatívne pôsobia na vývoj ľudského plodu, a majú dokonca vplyv na plodnosť žien i mužov. Rezíduá pesticídov v potravinách sú zodpovedné tiež za rôzne alergické reakcie, dýchacie ťažkosti, nežiaduce prejavy na koži, majú negatívny vplyv na funkciu nervovej sústavy, a to ako u dospelých, tak i u detí.